หากเดินทางจากกรุงเทพมหานคร ตามทางหลวงแผ่นดินหมายเลข 117 (นครสวรรค์ - พิษณุโลก) มหาวิทยาลัยนเรศวรจะตั้งอยู่ทางขวามือช่วงกิโลเมตรที่ 117 - 118 GPS : 16.743780, 100.196493
สำหรับการเดินทางจากภายในตัวเมืองพิษณุโลกมาที่มหาวิทยาลัยนเรศวร นั้น สามารถทำได้โดย รถโดยสารประจำทาง ปอ.12 ซึ่งจะมีจุดจอดอยู่ที่ สถานีรถไฟและสถานีขนส่งพิษณุโลก นอกจากนั้นสามารถเดินทางมาได้โดย
- รถแท็กซี่รับจ้าง (อัตราเหมาจ่าย 150 บาทจากตัวเมือง) ,คิงด้อมแท็กซี่ 055-222-222 และ สหกรณ์แท็กซี่ 055-388-888
- รถสามล้อรับจ้าง
สำหรับการเดินทางภายในมหาวิทยาลัย จะมี "โครงการขนส่งมวลชนมหาวิทยาลัยนเรศวร (ขสมน.)" ซึ่งเป็นรถประหยัดพลังงานที่ขับเคลื่อนด้วยพลังงานไฟฟ้าบริการรอบมหาวิทยาลัยโดยไม่คิดค่าใช้จ่ายตั้งแต่เวลา 6.30 น. ถึง 21.00 น.